蛋白按功能分，可分为以下几种：
1.白细胞介素(Interleukin，IL)
由多种细胞产生并作用于多种细胞的一类细胞因子。由于最初是由白细胞产生且又在白细胞间发挥作用，所以得名，现仍沿用此名。
2.干扰素(interferon，IFN)
具有干扰病毒复制的能力，故得名。其具有十分广泛的生物活性，在免疫应答和免疫调节中发挥重要作用，也是主要的促炎细胞因子之一。干扰素分为：I型(7种，如IFN-α和IFN-β)和II型(仅有IFN-Y)
3.肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)
由于在体内外均可直接杀伤肿瘤细胞而得名。其家族成员约有30个。
蛋白主要成员：
1) TNF-α，一种单核因子主要由单核细胞和巨噬细胞产生。
2) TNF-β，一种淋巴因子，主要由淋巴细胞、NK细胞等产生，其生物学活性与TNF-α相类似。
4.集落刺激因子(colony stimulating factor，CSF)
一组在体内外均可选择性刺激造血祖细胞增殖、分化并形成某一谱系细胞集落的细胞因子，包括巨噬细胞CSF、粒细胞CSF、巨噬细胞/粒细胞CSF、干细胞因子等。
5.生长因子(growth factor，GF)
一类可介导不同类型细胞生长和分化的细胞因子，根据其功能和所作用细胞的不同，分别命名为转化生长因子(TGF)、神经生长因子(NGF)、表皮生长因子(EGF)、血管内皮细胞生长因子(VEGF)、成纤维细胞生长因子(FGF)等。
6.趋化性细胞因子(chemokine)
一类对不同靶细胞具有趋化效应的细胞因子家族，可由白细胞和某些组织细胞分泌，是一个包括60多个成员的蛋白质家族。大部分成员含4个保守的半胱氨酸(cysteine，C)根据其N端半胱氨酸的排列方式，可分为CXC、CC、C、CX3C四个亚族。
